Según el Acuerdo CSU 13 de 1999 el Instituto de Biotecnología cuenta con un Comité Científico.

Para el 2012 en el Comité participan el Director del Instituto de Biotecnología-IBUN, el representante de los profesores ante el Consejo de Instituto y los docentes adscritos del IBUN. La secretaría técnica de este Comité la ejerce la profesional especializada que tiene a cargo la coordinación académica del Instituto. El Comité podrá invitar investigadores, profesores y gestores relacionados con el Instituto y con la Biotecnología.

Funciones del Comité:

• Proponer políticas de investigación, innovación y de desarrollo en Biotecnología a la comunidad del Instituto para su discusión y al Consejo para su aprobación.
• Hacer seguimiento y conceptuar de la ejecución del plan estratégico acordado con los grupos, la Dirección y el Consejo del Instituto.
• Revisar y aportar en el mejoramiento de los proyectos de investigación para que se dé su concordancia con las normas universitarias, y con las líneas y el plan estratégico del Instituto.
• Sugerir y evaluar formas de coordinación y diálogo entre los posgrados, los grupos y el plan estratégico del Instituto.
• Hacer seguimiento y conceptuar y sobre la calidad y la pertinencia de las líneas y proyectos de investigación, de acuerdo con la normativa y el plan de desarrollo vigentes en el IBUN.
• Hacer seguimiento sobre la calidad y eficiencia de la gestión administrativa para el manejo y ejecución de recursos, de acuerdo con la normativa y el plan de desarrollo vigentes en el IBUN.
• Todas las demás que le sean asignadas por el Consejo del Instituto de Biotecnología.